激光共聚焦顯微鏡（LaserScanningConfocalMicroscope簡稱LSCM）是以激光作為激發光源，采用光源針孔與檢測針孔共軛聚焦技術，對樣本進行斷層掃描，以獲得高分辨率光學切片的熒光顯微鏡系統，并帶有一套對其所觀察到的對象進行數字圖像分析處理的系統軟件。

　　激光共聚焦顯微鏡（LSCM）屬于細胞生物領域的新型儀器，在醫學基礎研究中應用于多重熒光影像、3D立體影像重建、3D動態影像獲取與分析、神經立體分布影像、形態與動態分析、次微米單晶熒光影像技術、多重熒光蛋白影像技術、熒光共振能量轉移、細胞離子流定量分析、長時間影像記錄、Z軸掃描與測量、基因影像分析、染色體多重熒光原色表現、活體胚胎研究、穿透光影像/反射光影像、材料表面分析、材料顯微硬度分析、晶園分析及薄膜分析。簡而言之，只要目的結構是用熒光探針標記的，都可用激光共聚焦顯微鏡觀察。

　　激光共聚焦顯微鏡在以下研究領域中應用較為廣泛：

　　1、細胞生物學：如：細胞結構、細胞骨架、細胞膜結構、流動性、受體、細胞器結構和分布變化、細胞凋亡機制；各種細胞器、結構性蛋白、DNA、RNA、酶和受體分子等細胞特異性結構的含量、組分及分布進行定量分析；DNA、RNA含量、利用特定的抗體對紫外線引起的DNA損傷進行觀察和定量；分析正常細胞和癌細胞細胞骨架與核改變之間的關系；細胞黏附行為等

　　2、生物化學：如：酶、核酸、受體分析、熒光原位雜交、雜色體基因定位等，利用共聚焦技術可以取代傳統的核酸印跡染交等技術，進行基因的表達檢測，使基因的轉錄、翻譯等檢測變的更加簡單、準確。

　　3、藥理學：如：藥物對細胞的作用及其動力學；藥物進入細胞的動態過程、定位分布及定量

　　4、生理學、發育生物學：如：膜受體、離子通道、離子含量、分布、動態；動物發育以及胚胎的形成，骨髓干細胞的分化行為；細胞膜電位的測量.熒光漂白恢復（FRAP）、熒光漂白丟失（FLIP）的測量等。

　　5、遺傳學和組胚學：如：細胞生長、分化、成熟變化、細胞的三維結構、染色體分析、基因表達、基因診斷。